Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt88Q9CPR6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt88Q9CPR6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt88Q9CPR6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt88Q9CPR6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt88Q9CPR6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt88Q9CPR6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt88Q9CPR6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt88Q9CPR6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt88Q9CPR6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt88Q9CPR6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt88Q9CPR6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt88Q9CPR6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt88Q9CPR6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt88Q9CPR6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt88Q9CPR6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt88Q9CPR6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt88Q9CPR6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt88Q9CPR6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt88Q9CPR6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt88Q9CPR6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt88Q9CPR6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt88Q9CPR6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt88Q9CPR6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt88Q9CPR6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt88Q9CPR6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt88Q9CPR6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt88Q9CPR6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt88Q9CPR6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt88Q9CPR6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt88Q9CPR6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt88Q9CPR6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt88Q9CPR6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt88Q9CPR6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt88Q9CPR6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt88Q9CPR6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt88Q9CPR6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt88Q9CPR6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt88Q9CPR6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms