Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAAF1Q9BRP4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms