Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkd1Q99MH6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms