Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nmd3Q99L48 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nmd3Q99L48 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms