Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU1

Dhdds, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Dhdds, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DhddsQ99KU1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DhddsQ99KU1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DhddsQ99KU1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms