Protein–RNA interactions for Protein: Q99J45

Nrbp1, Nuclear receptor-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrbp1Q99J45 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nrbp1Q99J45 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nrbp1Q99J45 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nrbp1Q99J45 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nrbp1Q99J45 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nrbp1Q99J45 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nrbp1Q99J45 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nrbp1Q99J45 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nrbp1Q99J45 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nrbp1Q99J45 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nrbp1Q99J45 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nrbp1Q99J45 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nrbp1Q99J45 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nrbp1Q99J45 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nrbp1Q99J45 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nrbp1Q99J45 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nrbp1Q99J45 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nrbp1Q99J45 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nrbp1Q99J45 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nrbp1Q99J45 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrbp1Q99J45 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrbp1Q99J45 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrbp1Q99J45 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrbp1Q99J45 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrbp1Q99J45 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrbp1Q99J45 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrbp1Q99J45 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrbp1Q99J45 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrbp1Q99J45 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nrbp1Q99J45 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nrbp1Q99J45 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrbp1Q99J45 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrbp1Q99J45 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrbp1Q99J45 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrbp1Q99J45 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nrbp1Q99J45 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nrbp1Q99J45 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms