Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CsprsQ99388 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms