Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Lmo1Q924W9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo1Q924W9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo1Q924W9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo1Q924W9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo1Q924W9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Lmo1Q924W9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lmo1Q924W9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmo1Q924W9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmo1Q924W9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Lmo1Q924W9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Lmo1Q924W9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmo1Q924W9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmo1Q924W9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmo1Q924W9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Lmo1Q924W9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Lmo1Q924W9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmo1Q924W9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Lmo1Q924W9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmo1Q924W9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmo1Q924W9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmo1Q924W9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmo1Q924W9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmo1Q924W9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmo1Q924W9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
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Lmo1Q924W9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmo1Q924W9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmo1Q924W9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmo1Q924W9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmo1Q924W9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmo1Q924W9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Lmo1Q924W9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Lmo1Q924W9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Lmo1Q924W9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmo1Q924W9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Lmo1Q924W9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmo1Q924W9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmo1Q924W9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmo1Q924W9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Lmo1Q924W9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Lmo1Q924W9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Lmo1Q924W9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms