Protein–RNA interactions for Protein: Q924L1

Letmd1, LETM1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letmd1Q924L1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Letmd1Q924L1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Letmd1Q924L1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Letmd1Q924L1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Letmd1Q924L1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Letmd1Q924L1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Letmd1Q924L1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Letmd1Q924L1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Letmd1Q924L1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Letmd1Q924L1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Letmd1Q924L1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Letmd1Q924L1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Letmd1Q924L1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Letmd1Q924L1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Letmd1Q924L1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms