Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med28Q920D3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms