Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx18Q91ZR2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx18Q91ZR2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx18Q91ZR2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1139.2 ms