Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Sh3bgrl3Q91VW3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Sh3bgrl3Q91VW3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bgrl3Q91VW3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bgrl3Q91VW3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bgrl3Q91VW3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Sh3bgrl3Q91VW3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bgrl3Q91VW3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Sh3bgrl3Q91VW3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bgrl3Q91VW3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh3bgrl3Q91VW3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bgrl3Q91VW3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bgrl3Q91VW3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh3bgrl3Q91VW3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Sh3bgrl3Q91VW3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Sh3bgrl3Q91VW3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Sh3bgrl3Q91VW3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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