Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc9Q8VC31 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms