Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ApobrQ8VBT6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ApobrQ8VBT6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms