Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SH3RF3Q8TEJ3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3RF3Q8TEJ3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms