Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4R6

Nup35, Nucleoporin NUP53, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35Q8R4R6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nup35Q8R4R6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms