Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3J1

Ndufs8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs8Q8K3J1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufs8Q8K3J1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms