Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q0

Commd9, COMM domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd9Q8K2Q0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Commd9Q8K2Q0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Commd9Q8K2Q0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Commd9Q8K2Q0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Commd9Q8K2Q0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Commd9Q8K2Q0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Commd9Q8K2Q0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms