Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Depp1Q8K2F3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms