Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Polr1eQ8K202 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms