Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S6

Spire2, Protein spire homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire2Q8K1S6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Spire2Q8K1S6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms