Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ep400Q8CHI8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ep400Q8CHI8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ep400Q8CHI8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ep400Q8CHI8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ep400Q8CHI8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ep400Q8CHI8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ep400Q8CHI8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ep400Q8CHI8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ep400Q8CHI8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ep400Q8CHI8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ep400Q8CHI8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ep400Q8CHI8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ep400Q8CHI8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ep400Q8CHI8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ep400Q8CHI8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ep400Q8CHI8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ep400Q8CHI8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ep400Q8CHI8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ep400Q8CHI8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ep400Q8CHI8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ep400Q8CHI8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ep400Q8CHI8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ep400Q8CHI8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ep400Q8CHI8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ep400Q8CHI8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ep400Q8CHI8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ep400Q8CHI8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ep400Q8CHI8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ep400Q8CHI8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ep400Q8CHI8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ep400Q8CHI8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ep400Q8CHI8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ep400Q8CHI8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ep400Q8CHI8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ep400Q8CHI8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ep400Q8CHI8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ep400Q8CHI8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms