Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup88Q8CEC0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nup88Q8CEC0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup88Q8CEC0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms