Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9L1

BC106179, BC106179 protein, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC106179Q8C9L1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC106179Q8C9L1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms