Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0E3

Trim47, Tripartite motif-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim47Q8C0E3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim47Q8C0E3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim47Q8C0E3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim47Q8C0E3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim47Q8C0E3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim47Q8C0E3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim47Q8C0E3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim47Q8C0E3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim47Q8C0E3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim47Q8C0E3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim47Q8C0E3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim47Q8C0E3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim47Q8C0E3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim47Q8C0E3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim47Q8C0E3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim47Q8C0E3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim47Q8C0E3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim47Q8C0E3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim47Q8C0E3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim47Q8C0E3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim47Q8C0E3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim47Q8C0E3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim47Q8C0E3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim47Q8C0E3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim47Q8C0E3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim47Q8C0E3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim47Q8C0E3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim47Q8C0E3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim47Q8C0E3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim47Q8C0E3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim47Q8C0E3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim47Q8C0E3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim47Q8C0E3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim47Q8C0E3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim47Q8C0E3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim47Q8C0E3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim47Q8C0E3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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