Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdsp2Q8BX07 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms