Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSK8

Rps6kb1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6kb1Q8BSK8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rps6kb1Q8BSK8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rps6kb1Q8BSK8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps6kb1Q8BSK8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps6kb1Q8BSK8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps6kb1Q8BSK8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps6kb1Q8BSK8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps6kb1Q8BSK8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps6kb1Q8BSK8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps6kb1Q8BSK8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps6kb1Q8BSK8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps6kb1Q8BSK8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps6kb1Q8BSK8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps6kb1Q8BSK8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps6kb1Q8BSK8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps6kb1Q8BSK8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps6kb1Q8BSK8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps6kb1Q8BSK8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rps6kb1Q8BSK8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rps6kb1Q8BSK8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rps6kb1Q8BSK8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rps6kb1Q8BSK8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rps6kb1Q8BSK8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rps6kb1Q8BSK8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rps6kb1Q8BSK8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rps6kb1Q8BSK8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rps6kb1Q8BSK8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rps6kb1Q8BSK8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rps6kb1Q8BSK8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rps6kb1Q8BSK8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rps6kb1Q8BSK8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rps6kb1Q8BSK8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rps6kb1Q8BSK8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rps6kb1Q8BSK8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rps6kb1Q8BSK8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rps6kb1Q8BSK8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms