Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe23Q8BGW3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe23Q8BGW3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms