Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Jmjd4Q8BFT6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Jmjd4Q8BFT6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms