Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cul9Q80TT8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms