Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP54Q7Z3B4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP54Q7Z3B4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms