Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lamp3Q7TST5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms