Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc93Q7TQK5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms