Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl35Q6ZWV7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms