Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfap2eQ6VUP9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tfap2eQ6VUP9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms