Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Casc1Q6TDU8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casc1Q6TDU8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casc1Q6TDU8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms