Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CtifQ6PEE2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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