Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6J4

Alkbh2, DNA oxidative demethylase ALKBH2, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh2Q6P6J4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alkbh2Q6P6J4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alkbh2Q6P6J4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Alkbh2Q6P6J4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alkbh2Q6P6J4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Alkbh2Q6P6J4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Alkbh2Q6P6J4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Alkbh2Q6P6J4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh2Q6P6J4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh2Q6P6J4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh2Q6P6J4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms