Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrimpolQ6P1E7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrimpolQ6P1E7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PrimpolQ6P1E7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms