Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Nop58Q6DFW4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nop58Q6DFW4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms