Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntn4Q69Z26 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntn4Q69Z26 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms