Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sptbn2Q68FG2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sptbn2Q68FG2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms