Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab3ipQ68EF0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms