Protein–RNA interactions for Protein: Q68D06

SLFN13, Schlafen family member 13, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN13Q68D06 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLFN13Q68D06 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms