Protein–RNA interactions for Protein: Q64444

Ca4, Carbonic anhydrase 4, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca4Q64444 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ca4Q64444 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ca4Q64444 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms