Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ccdc18Q640L5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ccdc18Q640L5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ccdc18Q640L5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ccdc18Q640L5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ccdc18Q640L5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ccdc18Q640L5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
Ccdc18Q640L5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ccdc18Q640L5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Ccdc18Q640L5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Ccdc18Q640L5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
Ccdc18Q640L5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ccdc18Q640L5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ccdc18Q640L5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
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