Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup62Q63850 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup62Q63850 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms