Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Kdm5dQ62240 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Kdm5dQ62240 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Kdm5dQ62240 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Kdm5dQ62240 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Kdm5dQ62240 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Kdm5dQ62240 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
Kdm5dQ62240 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Kdm5dQ62240 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Kdm5dQ62240 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Kdm5dQ62240 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Kdm5dQ62240 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Kdm5dQ62240 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Kdm5dQ62240 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Kdm5dQ62240 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Kdm5dQ62240 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Kdm5dQ62240 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Kdm5dQ62240 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Kdm5dQ62240 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Kdm5dQ62240 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Kdm5dQ62240 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Kdm5dQ62240 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Kdm5dQ62240 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
Kdm5dQ62240 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Kdm5dQ62240 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Kdm5dQ62240 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Kdm5dQ62240 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Kdm5dQ62240 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Kdm5dQ62240 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Kdm5dQ62240 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Kdm5dQ62240 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Kdm5dQ62240 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Kdm5dQ62240 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
Kdm5dQ62240 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Kdm5dQ62240 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Kdm5dQ62240 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Kdm5dQ62240 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Kdm5dQ62240 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Kdm5dQ62240 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
Kdm5dQ62240 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Kdm5dQ62240 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Kdm5dQ62240 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Kdm5dQ62240 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Kdm5dQ62240 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Kdm5dQ62240 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
Kdm5dQ62240 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Kdm5dQ62240 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Kdm5dQ62240 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Kdm5dQ62240 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Kdm5dQ62240 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Kdm5dQ62240 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
Kdm5dQ62240 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Kdm5dQ62240 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Kdm5dQ62240 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Kdm5dQ62240 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Kdm5dQ62240 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
Kdm5dQ62240 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Kdm5dQ62240 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Kdm5dQ62240 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Kdm5dQ62240 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms