Protein–RNA interactions for Protein: Q61473

Sox17, Transcription factor SOX-17, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox17Q61473 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox17Q61473 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox17Q61473 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox17Q61473 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox17Q61473 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox17Q61473 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox17Q61473 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox17Q61473 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox17Q61473 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox17Q61473 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox17Q61473 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox17Q61473 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox17Q61473 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox17Q61473 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox17Q61473 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox17Q61473 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox17Q61473 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox17Q61473 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox17Q61473 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox17Q61473 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox17Q61473 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox17Q61473 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox17Q61473 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox17Q61473 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox17Q61473 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox17Q61473 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox17Q61473 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox17Q61473 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms