Protein–RNA interactions for Protein: Q61210

Arhgef1, Rho guanine nucleotide exchange factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 920 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef1Q61210 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Arhgef1Q61210 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Arhgef1Q61210 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Arhgef1Q61210 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Arhgef1Q61210 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Arhgef1Q61210 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Arhgef1Q61210 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Arhgef1Q61210 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Arhgef1Q61210 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Arhgef1Q61210 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Arhgef1Q61210 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arhgef1Q61210 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms